A Igreja Matriz de Santa Maria construída entre 1336 e 1338 era a que gozava, outrora, de certas preferências e privilégios, sendo por esse motivo visitada em primeiro lugar, tanto pelos prelados, como pelos visitantes eclesiásticos. Foi restaurada entre o século XVII e XVIII e posteriormente em 1935.
Era desta Igreja que saíam todas as procissões reais organizadas na Vila, à excepção da procissão de Corpus Christi, que saía da Igreja de Santa Maria e da Igreja de São Pedro, alternadamente.
O vigário de Santa Maria tinha precedência com a Cruz em todas as funções religiosas da Vila de Manteigas, e na sua Igreja conservava-se durante todo o ano o Sacrário.
Nesta Igreja é invocada a Mãe de Deus sob o especial atributo de Nossa Senhora da Assunção.
Em meados do século XVIII esta Igreja possuía cinco altares: o Mor, do Santíssimo Sacramento, de características barrocas, os altares laterais das Almas e da Senhora da Conceição, da época do Renascimento e ainda dois particulares, o de São Miguel e o de Nossa Senhora da Apresentação, pertencentes à família do Capitão-Mor de Manteigas – Fernando José Saraiva e seus descendentes.
Actualmente, ao entrar na Igreja deparamos com o altar-Mor, dedicado a Santa Maria Maior; do lado esquerdo o altar do Sagrado Coração de Jesus e dois altares da Imaculada Conceição; do lado direito encontram-se os altares de São Sebastião e de Nossa Senhora da Assunção.